Высшим органом управления Некоммерческого партнерства «Гидроэнергетика России» является Общее собрание членов Партнерства.

Основной функцией Общего собрания членов Партнерства является обеспечение соблюдения Партнерством цели, в интересах которой Партнерство было создано.

К компетенции Общего собрания членов Партнерства в соответствии с Федеральным законом «О некоммерческих организациях» и Уставом Партнерства относится решение следующих вопросов:

• изменение Устава Партнерства;
• определение приоритетных направлений деятельности Партнерства, принципов формирования и использования его имущества;
• установление предельных размеров вступительных взносов, размера и порядка внесения регулярных и единовременных (целевых) членских взносов;
• утверждение финансового плана Партнерства и внесение в него изменений;
• утверждение годового отчета и годового бухгалтерского баланса Партнерства;
• избрание членов Наблюдательного совета Партнерства и досрочное прекращение их полномочий;
• избрание членов Ревизионной комиссии Партнерства, досрочное прекращение их полномочий и определение размеров вознаграждений и компенсаций членам Ревизионной комиссии Партнерства;
• образование постоянно действующего органа Партнерства - Общественного Совета;
• избрание Исполнительного директора Партнерства и досрочное прекращение его полномочий;
• исключение Члена Партнерства из Партнерства;
• реорганизация и ликвидация Партнерства;
• утверждение внутреннего документа Партнерства, определяющего порядок созыва и проведения Общего собрания членов Партнерства;
• решение иных вопросов, отнесенных Федеральным законом «О некоммерческих организациях» и Уставом Партнерства к компетенции Общего собрания членов Партнерства.